CADD522是一种小分子抑制剂，能够抑制RUNX2的DNA结合，调节相关转录因子的表达，包括下调基质金属蛋白酶-13和血管内皮生长因子，可能具有潜在的抗肿瘤活性。

AI-10-47是一种小分子抑制剂，能够干扰 CBFβ 与 RUNX 蛋白的结合，IC₅₀ 值为 3.2 μM。通过抑制这种结合，AI-10-47 可阻止 RUNX 驱动的癌症，如急性髓性白血病 (AML) 中的细胞增殖。

Muramyl dipeptide是一种合成免疫反应肽，通过诱导Runx2促进骨形成，直接通过MAPK途径上调Runx2基因表达来增强成骨细胞分化，间接通过降低RANKL/OPG比率来减弱破骨细胞分化。